«Основываясь на наших выводах, похоже, что индексный случай текущей вспышки в Нигерии не был завезен, но, вероятно, возник в результате вторичного события или событий с участием резервуарных хозяев», — сказал Густаво Паласиос, доктор философии.D., который возглавляет Центр геномных наук в U.S. Армейский медицинский научно-исследовательский институт инфекционных болезней. USAMRIID и многонациональная группа сотрудников опубликовали свой анализ в письме, размещенном на этой неделе в Интернете в журнале The Lancet Infectious Diseases.
По данным Всемирной организации здравоохранения, в период с сентября в разных частях Нигерии было зарегистрировано 172 подозреваемых и 61 подтвержденный случай MPXV, в том числе один смертельный случай.
4 и декабрь. 9, 2017. До этой вспышки с 1971 по 1978 год в регионе было зарегистрировано только десять таких случаев. Из-за этого упущения и недавних случаев заболевания в бассейне Конго необходимо было установить происхождение последней вспышки в Нигерии, а также выяснить, была ли вспышка результатом местного вторичного распространения зоонозов или завозом из другой эндемичной страны.
Исследование было поддержано Институтом Пастера в Дакаре (IPD) в Сенегале и США.S. Агентство по снижению оборонной угрозы. Оборудование для секвенирования было предоставлено IPD, где было проведено секвенирование, в рамках инициативы «Целевое приобретение эталонных материалов, расширяющих возможности» (TARMAC) и Управления по обеспечению безопасности биологической продукции (DBPAO) посредством присуждения задания Национальному институту стратегических исследований.
Группы по борьбе со вспышкой состояли из сотрудников Министерства здравоохранения штата Байелса, Учебной больницы Университета дельты реки Нигер, Нигерийской программы полевой эпидемиологии и лабораторной подготовки и Нигерийского центра по борьбе с болезнями.
По словам Брюса Гудвина, директора DBPAO, возможность секвенирования, созданная в IPD в рамках инициативы TARMAC, позволила значительно сократить время отклика — менее двух месяцев с момента получения образца до результатов, которые могут быть использованы специалистами общественного здравоохранения, работающими над контролем вспышка.
Эти усилия демонстрируют важность потенциала для определения последовательности в стране в сочетании с соответствующими протоколами и поддержкой для получения действенных данных. Данные, полученные в результате этого события, были использованы для проверки существующих анализов DBPAO, процесса в рамках TARMAC, который гарантирует, что DBPAO может выявлять заболевания, имеющие значение для биозащиты.
Вирус оспы обезьян был впервые обнаружен в 1958 году и вызывал спорадические вспышки среди людей в центральной и западной Африке со смертностью от одного до десяти процентов. Недавно вспышки MPXV произошли в Судане (2005 г.), Республике Конго и Демократической Республике Конго (2009 г.) и Центральноафриканской Республике (2016 г.).
Согласно Паласиосу, генетический анализ «генеалогического древа» вируса показывает, что изоляты, описанные в письме, наиболее близко сгруппированы с геномом, выделенным из случая заболевания человека в Ихие, штат Абиа, Нигерия, в 1971 году, что относительно близко к эпицентру заражения. текущая вспышка.