«Имея полную последовательность генома, мы можем теперь определить точное местоположение всех таких элементов, что может помочь отслеживать и лечить будущие вспышки», — сказал Рами Азиз, старший автор статьи. Азиз руководил исследованием в качестве приглашенного ученого, работающего в исследовательской группе системной биологии Бернхарда Палссона в инженерной школе Калифорнийского университета в Сан-Диего Джейкобс. Азиз также является профессором Каирского университета в Египте.Последовательность генома этого исторического штамма была впервые опубликована в 2001 году, но в геноме было много пробелов, которые нельзя было закрыть с помощью технологии секвенирования, доступной ученым в 2001 году.
Учитывая важность этого штамма как основной причины пищевых отравлений, Исследовательская группа системной биологии Палссона недавно секвенировала его геном, используя комбинацию данных секвенирования, полученную с помощью инструментов, произведенных Pacific Biosciences и Illumina.«Новые методы секвенирования и сборки позволяют полностью выявить надоедливые патогены; генетические характеристики больше некуда скрывать.
Полное генетическое разграничение нескольких патогенных штаммов, вероятно, не только улучшит наше понимание их характеристик, но и поможет найти и использовать их уязвимости, сказал Палссон, профессор биоинженерии Галлетти в Калифорнийском университете в Сан-Диего.