Работа, описанная в Медицинском журнале Новой Англии, предоставляет молекулярные доказательства передачи вируса Эбола (EBOV) между пережившим БВВЭ и его партнершей. По словам старшего автора Густаво Паласиоса, доктора философии из Медицинского научно-исследовательского института инфекционных заболеваний армии США (USAMRIID), это также демонстрирует ценность геномного наблюдения в режиме реального времени во время вспышки.CPT Сюзанна Мейт, доктор философии из USAMRIID, сказала, что ученые, работающие в LIBR в начале этого года, проанализировали образцы крови от пациентки, у которой был положительный результат на EBOV в марте 2015 года, когда в течение 30 дней не было новых задокументированных случаев.
Сообщалось, что пациент недавно имел половой акт с партнером-мужчиной, который пережил БВВЭ и в начале октября 2014 года был объявлен отрицательным по EBOV.По словам Мэйта, после смерти пациента 27 марта сотрудники общественного здравоохранения смогли заручиться согласием выжившего мужчины на получение и тестирование образца спермы от него.
Образец спермы показал положительный результат на EBOV с помощью количественной ОТ-ПЦР, но анализ показал, что уровень вирусной РНК был низким и требовал другого метода подготовки образца, чем тот, который первоначально использовался для секвенирования РНК EBOV из образцов острой фазы.«Мы реализовали новую стратегию обогащения в сотрудничестве с учеными из Illumina, Inc., которая сыграла решающую роль в получении необходимого покрытия для завершения последующего геномного анализа», — сказал Майкл Вили, доктор философии из USAMRIID. Секвенирование следующего поколения обогащенной РНК EBOV, выделенной из спермы выжившего мужчины, было использовано для сравнения генома на сходство с вирусной РНК, выделенной из образца крови пациентки.
«Геномы вируса Эбола, собранные из крови пациента и спермы выжившего, соответствовали прямой передаче», — прокомментировал Джейсон Ладнер, доктор философии из USAMRIID. «В образцах были обнаружены три генетические замены, которые не были обнаружены ни в каких других последовательностях вируса Эбола в Западной Африке».Кроме того, сказал Ладнер, эти три генетических изменения отличались от последней задокументированной цепи передачи в Либерии до этого случая. В сочетании с эпидемиологическими данными геномный анализ обеспечивает поддержку передачи вируса Эбола половым путем и стойкости инфекционного EBOV в сперме в течение более 179 дней после начала заболевания. Это заставило Центры по контролю и профилактике заболеваний и Всемирную организацию здравоохранения изменить свои рекомендации для выздоравливающих пациентов в отношении половых контактов до тех пор, пока не будет получена более определенная информация о том, как долго вирус Эбола может сохраняться в сперме.
Мариано Санчес-Локхарт, доктор философии, еще один член команды USAMRIID, объяснил, что некоторые органы, в том числе семенники, считаются «иммунопривилегированными» участками. Это означает, что иммунные реакции в этих местах жестко регулируются, чтобы ограничить или предотвратить повреждение тканей. Другие примеры «привилегированных» участков включают глаза, центральную нервную систему и беременную матку.
«Внутри этих сайтов вирусы могут уклоняться от системных иммунных ответов и сохраняться дольше, поскольку« иммунное давление »более ограничено, чем системно», — сказал Санчес-Локхарт, добавив, что для полного изучения этого механизма необходимы дальнейшие исследования.CPT Джеффри Кугельман, доктор философии из USAMRIID, сказал, что работа команды также имеет значение для разработки терапевтических средств против вируса Эбола, так как любые потенциальные методы лечения должны быть разработаны для достижения иммунных привилегированных участков.«Например, лекарства, выводящие вирус из кровотока, могут не справиться со всей инфекцией», — сказал он.Кугельман, который сыграл важную роль в создании возможности секвенирования генома на месте в LIBR, сказал, что исследование показывает, почему такая возможность необходима.
«Эта работа позволила принять более обоснованные решения о том, как управлять и контролировать распространение болезни», — прокомментировал он. «Быть в полевых условиях во время вспышки и иметь возможность предоставлять медицинским работникам и должностным лицам здравоохранения информацию о последовательности, близкую к реальному времени, — это первое».В работе также участвовали ученые из Либерийского института биомедицинских исследований, Центров по контролю и профилактике заболеваний, Всемирной организации здравоохранения, Национальных институтов здравоохранения и министерства здравоохранения Либерии.Вирус Эбола вызывает тяжелую геморрагическую лихорадку у людей и нечеловеческих приматов с высоким уровнем смертности и продолжает появляться в новых географических точках, включая Западную Африку, место самой крупной зарегистрированной на сегодняшний день вспышки.
По данным Всемирной организации здравоохранения, в Гвинее, Либерии и Сьерра-Леоне зарегистрировано более 28 000 подтвержденных, вероятных и подозреваемых случаев заболевания, при этом более 11 000 зарегистрированных случаев смерти.