Контроль конъюгации макромолекул, таких как ДНК и белки, может быть довольно сложной задачей, когда ученые хотят соединить их определенным образом и в определенном месте. Исследователи из Орхусского университета разработали новый и эффективный метод пометки белков ДНК, что значительно упростило управление процессом, чем раньше. Новый метод был разработан в Центре ДНК-нанотехнологий (CDNA) Датского национального исследовательского фонда в сотрудничестве с исследователями из Междисциплинарного центра нанонауки Орхусского университета (iNANO), кафедры химии и кафедры молекулярной биологии и генетики. Работа описана в высоконаучном журнале Nature Chemistry.
«Поддержание функции и активности белка часто требует присоединения к белку только одной цепи ДНК. В то же время может быть важно знать, где цепь ДНК прикреплена к белку. Обычно вы можете добиться этого только в том случае, если вы работают с генно-инженерными белками. Это трудоемкий и технически сложный процесс », — объясняет аспирант Кристиан Б. Розен, CDNA, Орхусский университет — один из исследователей нового метода.
Новый метод позволяет направить мечение белков ДНК в конкретный участок белка без предварительной генетической модификации белка. Другими словами, можно пометить природные белки, включая антитела.
Исследователи используют часть ДНК, которая сконструирована так, чтобы связываться с ионами металлов. Используя эту «контрольную палочку», они направляют другой фрагмент ДНК к участку связывания металла на белке, где он вступает в реакцию. Значительное количество белков связывает ионы металлов, что делает их пригодными для этого метода.
Важным моментом в использовании этого метода является то, что меченые белки сохраняют свою функциональность после связывания с ДНК.Исследователи подают заявку на патент на новый метод, который имеет потенциал во многих областях.«Наибольшее значение имеет тот факт, что мы можем использовать нашу технику для маркировки антител. Антитела, которые химически связаны (конъюгированы) с химиотерапевтическими средствами, представляют собой совершенно новый класс лекарств, в котором часть антитела используется для распознавания конкретной ткани, а химиотерапевтическая часть — используется для уничтожения клетки.
Когда вы помечаете антитела, важно, чтобы вы сохранили распознающий элемент антитела неповрежденным. В нашем методе мы поражаем постоянную часть антитела, а не вариабельную часть, которая содержит его распознающий элемент. Наша методика поэтому является общим для основного класса белков », — объясняет Энн Луиза Бэнк Кодал, CDNA, другой автор статьи.
Исследователи работают над дальнейшей разработкой метода, чтобы они могли прикреплять химиотерапевтические препараты к антителам, а не только к ДНК.