Исследование, проведенное доктором. Роберт М. Пленге из Гарвардской медицинской школы и Института Броуда в США и д-р. Юкинори Окада из Центра интегративных медицинских наук RIKEN в Японии, сотрудничающий с коллегами из 70 учреждений по всему миру, опубликован в журнале Nature.
Полногеномные ассоциативные исследования — это метод, используемый учеными для выявления генов, вызывающих заболевания человека. Текущее исследование Nature является первым, демонстрирующим, что интеграция информации, предоставленной общегеномными ассоциативными исследованиями, с существующими наборами данных геномной и биологической информации, такой как мишени для лекарств, может помочь в открытии лекарств для лечения болезней человека.
Ревматоидный артрит — это аутоиммунное заболевание, приводящее к воспалению суставов и поражающее 0.5-1% взрослого населения развитого мира. Считается, что заболевание вызывается сложной комбинацией генетических факторов и факторов окружающей среды, и было показано, что несколько генов связаны с заболеванием.
Тем не менее, большинство результатов было основано на исследованиях отдельных популяций, и на сегодняшний день крупномасштабных трансэтнических исследований не проводилось.
Международная команда провела метаанализ общегеномного ассоциативного исследования в общей сложности более 100000 субъектов европейского и азиатского происхождения — 29 880 пациентов с ревматоидным артритом и 73 758 контрольных — путем анализа около 10 миллионов генетических вариантов, называемых однонуклеотидным полиморфизмом (SNP). Они идентифицировали 42 новых региона в геноме (локусы), которые связаны с ревматоидным артритом, в результате чего общее количество известных локусов ревматоидного артрита достигло 101.
Путем проведения биоинформатических исследований, объединяющих существующие наборы данных с этой новой информацией, исследователи смогли точно определить 98 генов в этих 101 локусе, которые потенциально могут способствовать возникновению ревматоидного артрита. Объединив свои результаты с существующими базами данных о лекарствах, они демонстрируют, что эти гены действительно обладают множеством перекрывающихся областей с генами, на которые нацелены одобренные препараты от ревматоидного артрита — хотя это не было известно на момент разработки лекарств. Команда выявляет существующие лекарства, используемые для лечения рака, которые также нацелены на гены ревматоидного артрита и потенциально могут использоваться в качестве терапии заболевания, такие как ингибиторы CDK4 / 6.
Исследование биоинформатики также показывает, что существует значительное перекрытие между генами, участвующими в ревматоидном артрите, первичных иммунодефицитных расстройствах человека и раке крови.
«Это исследование проливает свет на основные гены, пути и типы клеток, которые способствуют возникновению ревматоидного артрита, и предоставляет доказательства того, что генетика ревматоидного артрита может предоставить важную информацию для открытия лекарств», — заключают авторы.
«Хотя есть предыдущие анекдотические примеры, наше исследование обеспечивает систематический подход, с помощью которого генетические данные человека могут быть эффективно интегрированы с другой биологической информацией для получения биологической информации и открытия лекарств», — добавляют они.