Система, получившая название «iPipet», превращает iPad или любой планшетный компьютер в «умный стол», который управляет выполнением сложных протоколов дозирования. Пользователи iPipet также могут делиться друг с другом своими проектами дозирования, распространяя опыт среди исследовательского сообщества. Система, созданная исследователями лаборатории Уайтхеда Янива Эрлиха, подробно описана в письме, опубликованном на этой неделе в журнале Nature Methods.
Эрлих говорит, что в сегодняшних экспериментах часто используются высокопроизводительные методы, сочетающие большое количество образцов с крупномасштабными и сложными схемами дозирования. Ошибки при дозировании могут привести к провалу эксперимента. Хотя роботы для работы с жидкостями кажутся логичным выбором для такой работы, они также чрезвычайно дороги, сложны в программировании и требуют обученного персонала.
Более того, они могут столкнуться с техническими сбоями, начиная от погнутых или забитых наконечников до неспособности улавливать жидкости, лежащие близко к дну отдельных скважин.«Нам была нужна альтернатива дорогостоящим роботам, которая позволила бы нам выполнять сложные протоколы дозирования», — говорит Эрлих. «Это особенно важно при работе с человеческими образцами, которые часто находятся в ограниченном количестве».
iPipet освещает отдельные лунки стандартных 96- или 384-луночных планшетов, помещенных поверх экрана планшета, помогая пользователям переносить образцы или реагенты из исходного в целевые планшеты в соответствии с конкретным дизайном. Пользователи создают свои собственные протоколы в файлах Microsoft Excel в формате, разделенном запятыми, и загружают их на веб-сайт iPipet (http://ipipet.teamerlich.org), который создает загружаемую ссылку для выполнения на планшетном компьютере. На сайте iPipet есть различные демонстрации и обучающее видео.Итак, насколько хорошо работает iPipet?
Прекрасно, по мнению сотрудников лаборатории Эрлиха. При тестировании инструмента на роботе, работающем с жидкостями, iPipet позволил выполнить почти 3000 этапов дозирования фиксированного объема примерно за семь часов. После значительного времени, затраченного на калибровку, робот сделал только половину этого количества шагов за то же время. На сегодняшний день одна из немногих проблем, с которыми сталкиваются лабораторные пользователи, — это удерживать планшеты с лунками в фиксированном положении на экране планшета.
Для этого команда Эрлиха предлагает решение: пластиковый адаптер, напечатанный на 3D-принтере, который пользователи могут создать из файла, доступного через веб-сайт iPipet.«Вся система iPipet имеет открытый исходный код, — говорит Эрлих. «Мы хотим получить максимальную пользу для сообщества и позволить им и дальше развивать этот новый человеко-машинный интерфейс для биологических экспериментов».