Этот подход способствовал успешному картированию генов, участвующих в многочисленных заболеваниях человека, таких как болезнь Хантингтона и муковисцидоз, что является важным первым шагом в понимании этих состояний.
В растениях метод позиционного клонирования традиционно использовался в исследованиях модельных организмов, таких как рис и арабидопсис, что дает важные сведения о генетике растений.
Исследователи из Университета Бригама Янга и Университета Рутгерса разработали протокол, который подчеркивает полезность этого метода для таксонов растений с гораздо более крупными геномами, таких как кукуруза. Подробный протокол опубликован в январском выпуске Applications in Plant Sciences .
«Кукуруза — самая важная зерновая культура в США и одна из самых важных в мире», — говорит Клинтон Уиппл, автор исследования. «Изначально мы беспокоились, что большой размер генома кукурузы сделает позиционное клонирование нереалистичным, требуя очень больших картографических популяций. Однако эти опасения оказались в значительной степени необоснованными, поскольку мы успешно использовали эту технику с популяциями, по размеру аналогичными арабидопсису и рису, которые имеют значительно меньшие геномы."
Теперь, когда доступна полная последовательность генома кукурузы, позиционное клонирование можно использовать для идентификации генов, ответственных за признаки, вызванные мутациями, а также естественными генетическими вариациями.
Хотя этот метод не нов и используется генетиками в течение довольно долгого времени, ранее не публиковалось ни одного общего протокола. «Насколько мне известно, подробный пошаговый протокол позиционного клонирования ранее не публиковался (ни для одного вида), и мы надеялись заполнить эту дыру в литературе», — говорит Уиппл.
«Хотя мы сосредоточились на кукурузе, многое из того, что мы описали, можно применить к любым видам растений, которые генетически поддаются обработке и имеют секвенированный геном. Учитывая быстро снижающиеся затраты на секвенирование, многие другие виды секвенируются, в том числе новые модели, важные для эволюционных и экологических вопросов, которые могут извлечь выгоду из функционального понимания, которое может дать позиционное клонирование."