Выводы исследователей дают важную информацию о механизмах, лежащих в основе рака мочевого пузыря, который, по оценкам, стал причиной более 15000 смертей в США в 2014 году. TCGA — это сотрудничество, совместно поддерживаемое и управляемое Национальным институтом рака (NCI) и Национальным институтом исследования генома человека (NHGRI), которые входят в состав Национальных институтов здравоохранения.
«Ученые TCGA Research Network продолжают разгадывать геномные сложности многих распространенных и часто трудноизлечимых форм рака, и эти результаты определяют новые направления исследований и ускоряют разработку новых методов лечения рака», — сказал директор NIH Фрэнсис Коллинз, штат Массачусетс.D., Ph.D.
В этом исследовании, опубликованном в Интернете, Ян.
29, 2014, в журнале Nature, исследователи изучили рак мочевого пузыря, поражающий мышцу мочевого пузыря, самую смертельную форму болезни. Текущие стандартные методы лечения мышечно-инвазивного рака мочевого пузыря включают хирургическое вмешательство и лучевую терапию в сочетании с химиотерапией.
Не существует признанных препаратов второго ряда — второго выбора для лечения, когда начальная терапия не работает, — и нет утвержденных таргетных агентов для этого типа рака мочевого пузыря. В 2014 году в США будет диагностировано около 72000 новых случаев рака мочевого пузыря.
«Этот проект значительно улучшил наше понимание молекулярной основы рака мочевого пузыря и его связи с другими типами рака», — сказал ведущий автор Джон Вайнштейн, M.D., Ph.D., профессор и заведующий кафедрой биоинформатики и вычислительной биологии Техасского университета М.D.
Онкологический центр Андерсона в Хьюстоне. «В долгосрочной перспективе выявленные потенциальные молекулярные мишени могут помочь нам персонализировать терапию с учетом характеристик опухоли каждого пациента."
«Настоящий ажиотаж по поводу этого проекта заключается в том, что теперь у нас есть меню лечения и направлений исследований, которыми мы должны следовать», — сказал Сет Лернер, M.D., профессор и заведующий кафедрой урологической онкологии Медицинского колледжа Бейлора в Хьюстоне и один из ведущих авторов статьи. "Поле готово использовать эту информацию для достижения новых успехов в лечении очень трудно поддающейся лечению формы рака мочевого пузыря."
Исследовательская группа проанализировала данные ДНК, РНК и белков, полученные в результате исследования 131 мышечно-инвазивного рака мочевого пузыря у пациентов, которые еще не получали химиотерапию, лучевую терапию или какой-либо другой вид терапии. Ученые обнаружили повторяющиеся мутации в 32 генах, в том числе в девяти, которые ранее не были известны как сильно мутировавшие.
Они обнаружили мутации в гене TP53 почти в половине образцов опухолей, а мутации и другие аберрации в пути RTK / RAS (который обычно поражается при раке) в 44 процентах опухолей. TP53 производит белок-супрессор опухолей p53, который помогает регулировать деление клеток. РТК / РАН участвует в регулировании роста и развития клеток.
Исследователи также показали, что гены, которые регулируют хроматин — комбинацию ДНК и белка в ядре клетки, которая определяет, как гены экспрессируются, — чаще мутировали при раке мочевого пузыря, чем при любом другом распространенном раке, изученном на сегодняшний день.
Эти данные предполагают возможность разработки методов лечения изменений ремоделирования хроматина.
В целом, исследователи определили потенциальные мишени для лекарств в 69% исследованных опухолей.
Они обнаружили частые мутации в гене ERBB2 или HER2. Исследователи также выявили повторяющиеся мутации, а также слияния с участием других генов, таких как FGFR3, и пути PI3-киназы / AKT / mTOR, которые помогают контролировать деление и рост клеток и для которых уже существуют целевые препараты.
Поскольку ген HER2 и кодируемый им белок HER2, влияющий на рост и развитие клеток, вовлечены в значительную часть случаев рака груди, ученые хотели бы выяснить, могут ли новые разрабатываемые средства против рака груди также быть эффективными при лечении подгруппы пациентов с раком мочевого пузыря.
«Мы организовали нашу медицинскую помощь вокруг пораженной системы органов», — сказал доктор.
Лернер сказал. "Мы думали, что каждый из этих видов рака имеет свои собственные характеристики, уникальные для пораженного органа. Мы все чаще обнаруживаем, что рак пересекает эти линии на молекулярном уровне, где некоторые отдельные виды рака, поражающие разные органы, выглядят очень похоже. Поскольку целевые лекарственные средства проходят доклиническую и клиническую разработку, мы надеемся, что вместо лечения 10 процентов рака груди или 5 процентов рака мочевого пузыря в конечном итоге будет иметь смысл лечить несколько типов рака, при которых мишень выражена."Та же тема проходит через проект Pan-Cancer TCGA, который направлен на выявление геномных сходств у разных типов рака с целью получения более глобального понимания поведения и развития рака.
«Становится все более очевидным, что есть геномные общие черты рака, которыми мы можем воспользоваться в будущем», — сказал директор NHGRI Эрик Д. Зеленая, M.D., Ph.D. "TCGA предоставляет нам набор возможностей для разработки новых лекарств от рака."
Ученые также обнаружили потенциальную вирусную связь с раком мочевого пузыря. Известно, что вирусы папилломы животных могут вызывать рак мочевого пузыря. В небольшом количестве случаев ДНК вирусов, особенно ВПЧ16, формы вируса, ответственного за рак шейки матки, была обнаружена в опухолях мочевого пузыря.
Это говорит о том, что вирусная инфекция может способствовать развитию рака мочевого пузыря.
Табак — главный фактор риска рака мочевого пузыря; более 70 процентов случаев, проанализированных в этом исследовании, произошли у бывших или нынешних курильщиков. Однако анализ не выявил серьезных молекулярных различий между опухолями, развившимися у пациентов с или без курения в анамнезе.
«Окончательный молекулярный портрет рака мочевого пузыря, сделанный сетью TCGA, выявил многообещающий ряд потенциальных терапевтических целей, которые обеспечивают план для исследований активности существующих и новых терапевтических агентов при этом раке», — сказал Луи Штаудт, штат Массачусетс.D., Ph.D., директор Центра онкологической геномики NCI.