C. gattii, которая, вероятно, возникла в Бразилии, является причиной десятков смертей в последние годы с тех пор, как она была впервые обнаружена в 1999 году на острове Ванкувер, Британская Колумбия, Канада, далеко за пределами ее обычных тропических местообитаний.«Мы определили несколько генов, которые могут сделать штаммы вспышек более способными к выживанию в более холодной окружающей среде и сделать их более опасными для легких», — сказал Дэвид Энгельталер, директор программ и операций подразделения геномики патогенов TGen (TGen North) и ведущий автор книги исследование опубликовано сегодня в научном журнале mBio.Это исследование должно лечь в основу дополнительных исследований того, как и почему распространяется и появляется C. gattii. Он выявил несколько новых геномных мишеней для диагностических тестов и возможные новые мишени для терапевтических препаратов и профилактических вакцин.
«Тщательно проанализировав геномы десятков штаммов вспышек, а также глобально различных штаммов, мы смогли тщательно сравнить и определить геномные различия, которые могут вызвать их клинические и экологические изменения», — сказал доктор Пол Кейм, один из исследователей. старшие авторы. Доктор Кейм также является директором TGen North и директором Центра микробной генетики и геномики в Университете Северной Аризоны (NAU).
TGen в сотрудничестве с Центрами США по контролю и профилактике заболеваний и другими организациями провела один из крупнейших глобальных анализов генома грибов определенного вида, чтобы понять его появление в новых условиях. В коллективную группу вошли 24 исследователя из 13 учреждений в семи странах, которые секвенировали 115 геномов C. gattii, собранные из 15 стран.«Думая глобально, мы смогли лучше понять, что происходит на местном уровне», — сказал Энгельталер.C. gattii, как правило, был тропическим грибком до того, как был обнаружен в умеренных районах острова Ванкувер.
Вскоре оно переросло в новое, более опасное легочное заболевание, которое быстро распространилось на материковую часть Канады и на юг, в штат Вашингтон. За этим последовала вспышка в Орегоне другого нового штамма C. gattii, который также показал повышенную летальность и таким же образом распространился по Тихоокеанскому Северо-Западу.C. gattii ранее был связан с неврологическими заболеваниями у штаммов, обнаруженных в других странах мира. Но штаммы, обнаруженные на северо-западе Тихого океана, не только создают новую экологическую нишу, но также демонстрируют повышенную вирулентность и вызывают тяжелые легочные инфекции.
«Мы предоставляем доказательства того, что штаммы Pacific Northwest произошли из Южной Америки и идентифицировали многочисленные гены, потенциально связанные с адаптацией к среде обитания, выражением вирулентности и клиническими проявлениями», — сказал доктор Виланд Мейер, другой старший автор исследования.«Дальнейшее выяснение и характеристика этих генетических особенностей может привести к улучшению диагностики и лечения инфекций, вызванных этим постоянно развивающимся грибком», — сказал д-р Мейер, который связан с: Сиднейской медицинской школой и больницей Вестмид; Сиднейский университет; и Уэстмидский институт медицинских исследований тысячелетия.
В этом исследовании делается вывод о том, что: «Необходима бдительность общественного здравоохранения для появления в регионах, где C. gattii не считается эндемичным».Новые тесты, разработанные для этого исследования TGen, облегчают обнаружение этого и других грибков и могут привести к более эффективному мониторингу и лечению.
Те же инструменты, которые использовались в этом исследовании, также использовались для расследования причины вспышки грибкового менингита, связанной с инъекциями стероидов, а также недавней вспышки Valley Fever в штате Вашингтон.