ВГС является основной причиной хронических заболеваний печени, цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы, от которых страдают до 180 миллионов человек во всем мире. ВГС часто приобретает устойчивость к противовирусным препаратам прямого действия.
Сообщается, что наличие мутации Y93H до лечения является важным предиктором вирусологической неудачи. Прямое секвенирование — широко используемый метод обнаружения этой мутации. Однако он способен обнаруживать вирусные субпопуляции только с частотой от 10% до 20%. В последнее время секвенирование нового поколения применялось как более чувствительный метод анализа вирусных мутаций, но он по-прежнему сложен в исполнении и дорог для широкого клинического использования.
Комбинируя вложенную ПЦР и анализ Invader с хорошо разработанными праймерами и зондами, мутация Y93H, резистентная к лекарствам, может быть обнаружена с высокой вероятностью успеха 98.9% среди 702 японских пациентов с генотипом 1b ВГС.
«Наша система анализа также показала гораздо более низкий предел обнаружения Y93H, чем при использовании прямого секвенирования, и частоты Y93H, полученные этим методом, хорошо коррелировали с таковыми при анализе глубокого секвенирования."Профессор Кадзуаки Чаяма, главный исследователь этого исследования в Университете Хиросимы, объяснил.
Доля пациентов с мутантным штаммом Y93H, оцененная с помощью этой системы, составила 23 человека.6%, и этот показатель сопоставим с показателем, измеренным с помощью ПЦР в реальном времени, и оценивается между показателями глубокого и прямого секвенирования, о которых сообщалось в японской популяции, что, по-видимому, отражает нижний предел обнаружения Y93H.
Эта новая система показала высокий уровень успешности анализа и была более чувствительной при обнаружении Y93H, чем прямое секвенирование. Оценка штамма Y93H может предоставить важную информацию для прогнозирования прогрессирования заболевания у пациентов с генотипом 1b HCV.