Глубокий комплексный геномный анализ переклассифицирует опухоли головного мозга более низкой степени злокачественности

«Непосредственным клиническим следствием является то, что группа пациентов с опухолями, ранее классифицированными как более низкая степень, должна фактически лечиться как пациенты с глиобластомой и получать такой стандарт лечения — химиотерапию и облучение темозоломидом», — сказал ведущий автор Роэль Верхаак, доктор философии. доцент кафедры биоинформатики и вычислительной биологии онкологического центра им. М. Д. Андерсона Техасского университета.«Классификация опухолей более низкой степени злокачественности в этих трех молекулярных кластерах более точно характеризует их, чем существующие методы, используемые для группировки и классификации опухолей», — сказал Верхаак.

Основные молекулярные маркеры, которые определяют три опухолевых кластера — мутационный статус генов IDH1 и IDH2 и потеря хромосомных плеч 1p и 19q — уже регулярно проверяются в клинической практике, отметил Верхаак, поэтому внедрение новых категорий может быть осуществлено относительно. быстро.Верхаак и его коллеги проанализировали данные исследований опухолей мозга в Атласе генома рака (TCGA).

Отсутствие мутаций IDH1 / 2 резко снижает выживаемостьОпухоли головного мозга возникают в глии или поддерживающих клетках головного мозга и теперь классифицируются по их гистологии — характеристикам, видимым с помощью микроскопа — и клеткам их происхождения, астроцитам или олигодендроцитам.Классифицированные таким образом олигодендроглиомы и астроцитомы 2 и 3 степени демонстрируют медианную общую выживаемость пациентов в диапазоне от трех до десяти лет.

Это сопоставимо с 14 месяцами у пациентов с мультиформной глиобластомой — сложной и агрессивной астроцитомой. Глиобластомы составляют 55-60 процентов глиом, при этом астроцитомы более низкой степени злокачественности составляют 15-20 процентов случаев, олигодендроциты — 12-20 процентов и комбинированные олиго-астроцитомы — 5-10 процентов.Исследователи всесторонне проанализировали 254 глиомы TCGA более низкого уровня для экспрессии генов, белков и микроРНК, метилирования ДНК и профилей копий генов, чтобы сгруппировать случаи по категориям.

Затем они провели «кластерный» анализ, охвативший все данные.«Результаты в подавляющем большинстве указывают на естественное объединение глиом более низкого уровня в три суперкластера на основе мутационного статуса генов IDH1 и IDH2 и ко-делеции плеч хромосом 1p и 19q», — сказал Верхаак.Предыдущее исследование TCGA показало, что пациенты с глиобластомой с мутациями IDH1 / IDH2 в опухолях имеют улучшенный прогноз. Верхаак сказал, что неизвестно, являются ли эти мутации маркерами хорошего прогноза или действительно играют роль в предотвращении прогрессирования опухоли.

Ко-делеция 1p19q была связана с повышенной чувствительностью опухоли к химиотерапии и более длительным выживанием пациентов с олигодендроглиомой.Каждая молекулярная группа включает опухоли всех степеней и категорий астроцитомы, олигодендроцитомы и олигоастроцитомы.

Три молекулярных суперкластера глиом более низкого уровня имеют либо: • IDHI1 и IDH2 дикого типа без мутаций. Эти опухоли похожи на глиобластому, средняя выживаемость пациентов составляет 18 месяцев. • Мутации IDH1 / IDH2 и хромосомные плечи 1p / 19q не повреждены. Нет доминирующей гистологии или типа оценки, средняя выживаемость около семи лет. • Мутации IDH1 / IDH2 и ко-делеция 1p / 19q.

Этот кластер состоял в основном из олигодендроглиом (84%), а средняя выживаемость составляла около восьми лет.