Государственно-частный совместный проект координируется IWGSC и совместно с Нильсом Штайном из IPK Gatersleben в Германии, Кертисом Позняком из Центра развития сельскохозяйственных культур Университета Саскачевана в Канаде, Эндрю Шарпом из Глобального института продовольственной безопасности в Канаде и Джесси Поланд из Канзасского государственного университета в США. Среди участников проекта также исследователи из Illumina, Inc .; NRGene в Израиле и США; Тель-Авивский университет в Израиле; и Французский национальный институт сельскохозяйственных исследований (INRA).Финансирование этого проекта было предоставлено Genome Canada, Genome Prairie, Министерством сельского хозяйства Саскачевана, Комиссией по развитию пшеницы Саскачевана и Альберты, а также Фондом исследований западного зерна через проект Canadian Triticum Applied Genomics (CTAG2), Университет штата Канзас через Национальный фонд США. Программа исследования генома растений Научного фонда и Illumina, Inc.
Новые данные помогут ускорить получение высококачественной эталонной последовательности генома мягкой пшеницы. Нильс Штайн объяснил: «Новая сборка дробовика de novo из мягкой пшеницы, созданная NRGene, представляет собой крупный прорыв в интегрированной стратегии IWGSC по обеспечению высококачественной эталонной последовательности для каждой из 21 хромосомы мягкой пшеницы».
Келли Эверсол, исполнительный директор IWGSC, приветствовала результаты: «Предварительные результаты, полученные NRGene, впечатляют. Мы ждали несколько лет, чтобы получить высококачественную сборку полногеномной последовательности, которая дополнит нашу стратегию на основе хромосом и ускорит доставку. последовательности.
Таким образом, эта сборка происходит точно в нужное время, потому что ее можно интегрировать с ресурсами, специфичными для хромосом IWGSC, разработанными за последние 10 лет (например, последовательностями дробовика хромосом, физическими картами и секвенированием на основе физических карт) для доставки высококачественная эталонная последовательность для генома пшеницы менее чем за два года ".Данные о сборке всего генома будут интегрированы с данными последовательностей на основе физических карт для создания высококачественной упорядоченной последовательности для каждой хромосомы пшеницы, которая точно определяет местонахождение генов, регуляторных элементов и маркеров вдоль хромосом, предоставляя бесценные инструменты для селекционеров пшеницы.
«Эта новая последовательность генома пшеницы, созданная IWGSC и его партнерами, является важным вкладом в понимание генетической схемы одной из самых важных сельскохозяйственных культур в мире», — сказал Кертис Позняк. «Это предоставит исследователям пшеницы захватывающий новый ресурс для выявления наиболее влиятельных генов, важных для адаптации пшеницы, реакции на стресс, устойчивости к вредителям и повышения урожайности».Результаты сборки всего генома будут представлены в нескольких цехах завода. Конференция по геному животных пройдет в Сан-Диего, США, с 9 по 13 января 2016 года. Все данные будут доступны в репозитории последовательностей пшеницы IWGSC в URGI-INRA.
Пшеница является основным продуктом питания более 35% мирового населения и составляет 20% всех калорий, потребляемых во всем мире. По мере роста мирового населения растет и его зависимость от пшеницы.
Чтобы удовлетворить будущие потребности прогнозируемого населения мира в 9,6 миллиарда к 2050 году, урожайность пшеницы должна увеличиваться на 1,6% каждый год. Поскольку доступность новых земель ограничена для сохранения биоразнообразия, а водные и питательные ресурсы становятся все более дефицитными, большая часть этого увеличения должна быть достигнута за счет улучшения урожая и характеристик земель, возделываемых в настоящее время.
Высококачественная эталонная последовательность генома предоставит подробную геномную информацию, необходимую для поддержки исследований пшеницы, обеспечивающих достижение этой цели.