Исследование сосредоточено на тесте, называемом анализом переменных тандемных повторов с несколькими локусами переменных (MLVA). Тест, который все чаще используется при обнаружении и расследовании вспышек болезней пищевого происхождения, анализирует определенные последовательности ДНК (называемые локусами), которые меняются достаточно быстро с течением времени, чтобы отличить штаммы вспышки от других циркулирующих штаммов бактерий, но не так быстро, чтобы связи могли быть замаскированы изменениями, возникшими в ходе вспышки.
Однако темпы изменения профилей MLVA непосредственно на наличие сальмонеллы не исследовались, и поэтому иногда неясно, как эти профили следует интерпретировать в контексте выявления и расследования вспышек.В ходе исследования исследователи вырастили изолят Salmonella Typhimurium в результате вспышки пищевого отравления в Австралии и наблюдали изменения в его профиле MLVA в течение более чем 28 000 поколений роста в лаборатории. Затем, используя ту же бактериальную линию, они наблюдали изменения профиля MLVA в течение 500 дней роста у мышей.Они оценили скорость изменения числа копий в каждом из пяти локусов, которые обычно используются для MLVA S. Typhimurium.
В трех локусах произошли изменения в ДНК, а в двух — нет. Основываясь на этих результатах, исследователи рекомендуют, чтобы изоляты с нулевой или одной вариацией в трех быстро меняющихся локусах, но без различий в двух других, считались частью одного и того же кластера.
Они также отметили, что относительные скорости изменений среди локусов были одинаковыми в исследованиях на чашках Петри и в исследовании на мышах.«Это говорит нам, что нам не нужно беспокоиться о том, откуда были выделены бактерии — от людей или из пищи», — говорит Кэтрин Холт, автор исследования.MLVA используется для исследования болезней пищевого происхождения, помимо сальмонеллы, включая листерии и кишечную палочку. «Это основной метод расследования вспышек сальмонеллы в Европе, Великобритании, Австралии и других странах», — говорит Холт.
«В США Центры по контролю и профилактике заболеваний используют еще один метод, называемый PFGE, для начальных расследований и следует этому с MLVA», — говорит она.