До сих пор считалось, что длина этих поли (A) хвостов имеет решающее значение для стабильности и трансляции мРНК, но их фактическая корреляция была неизвестна. Исследователи, работающие в Центре исследований РНК IBS, показали, что эффективность трансляции и длина поли (A) хвоста не коррелируют линейно, а связаны только в ограниченном диапазоне. Это ставит под сомнение устоявшееся представление о трансляции мРНК и предлагает новое понимание цикла соматических клеток. Чтобы показать это, команда IBS использовала два процесса измерения, первый из которых называется TAIL-seq, который они впервые применили в 2014 году для подсчета нуклеотидов на геномном уровне, а также профилирование рибосом, которое показывает эффективность трансляции.
Первый автор Пак Чон-Ын сказал: «Объединив эти две техники, я смог сравнить длину поли (A) хвоста и эффективность перевода и выяснить, есть ли между ними корреляция».Самая недавно установленная теория заключалась в том, что длина хвоста и эффективность связаны только в эмбриональных клетках, но не в соматических клетках, поскольку в эмбриональных клетках клеточные циклы синхронизированы, а в соматических клетках они гетерогены. По словам Пак, «мы синхронизировали клеточные циклы в соматических клетках для получения однородных данных и обнаружили, что существует определенная длина поли (A) хвостов, которые могут обеспечить полностью эффективную трансляцию в соматических клетках».
Они также обнаружили несколько генов, которые деаденилированы (они теряют часть своего аденина) перед M-фазой (фаза деления клетки, называемая митозом), и они увидели, что когда длина хвоста становится короче 20 аденинов, он подавляет трансляцию. . Парк считает, что это подавление важно для прогрессирования M-фазы.«Определение точной роли поли (А) хвоста очень важно, — говорит Парк, — проводя это исследование, мы пытаемся найти регулирующую роль, которую играет поли (А) хвост». Основываясь на этом исследовании, есть две вещи, которыми команда планирует заниматься в будущем. Во-первых, теперь они знают, какие гены регулируют поли (A) хвосты, и хотят знать, как они регулируются.
Во-вторых, они пытаются оценить важность этой регуляции в развитии клеточного цикла.Интересно, что они обнаружили большие различия в длинах хвостов регуляторных генов поли (A) хвоста, таких как CDK1, TOP2A и FBXO5. Эти гены выполняют известную функцию в клеточном цикле; они регулируют прогрессирование в M-фазе.
Парк говорит: «В отношении этих генов большинство исследований было сосредоточено на уровне белка. Будет интересно изучить, что такого особенного в их мРНК».
Неправильная регуляция клеточного цикла — признак рака человека. Исследователи из Центра исследований РНК специально не изучают взаимосвязь цикла поли (А) хвоста с онкогенезом, но Парк считает, что это исследование «помогает заложить основу для дальнейшей работы, которая может быть применена к исследованиям рака. "