Исследование было только что опубликовано в Журнале данных о биоразнообразии.Хотя в 2012 году систематиками было обнаружено 13 494 новых вида животных, разнообразие животных на планете продолжает сокращаться с беспрецедентной скоростью. Обеспокоенные быстрыми темпами исчезновения, ученые были вынуждены использовать так называемый подход «турбо-таксономии», когда для управления сохранением требуется быстрое описание видов.
Признавая необходимость быстрых описаний, авторы нового исследования представляют другую «крайность» для таксономического описания: «новый вид будущего». Международная группа ученых из Болгарии, Хорватии, Китая, Великобритании, Дании, Франции, Италии, Греции и Германии проиллюстрировала целостный подход к описанию нового пещерного вида многоножки Eupolybothrus cavernicolus, недавно обнаруженного в отдаленном карстовом регионе Хорватии. Этот проект был результатом сотрудничества GigaScience, Китайского национального генного банка, BGI-Shenzhen и Pensoft Publishers.
Eupolybothrus cavernicolus стал первым эукариотическим видом, для которого, в дополнение к традиционному морфологическому описанию, ученые предоставили транскриптомный профиль, данные штрих-кодирования ДНК, подробную анатомическую рентгеновскую микротомографию (микро-КТ) и фильм о живом образце. задокументировать важные черты его поведения. Благодаря использованию микро-КТ сканирования нового вида впервые создается набор морфологических и анатомических данных с высоким разрешением — «кибертип», дающий каждому виртуальный доступ к образцу.«Эффективное сообщение результатов секвенирования следующего поколения требует публикации данных следующего поколения», — говорит профессор Любомир Пенев, управляющий директор Pensoft Publishers. «Недостаточно просто собрать« большие »данные.
Настоящая проблема возникает в тот момент, когда данными нужно управлять, хранить, обрабатывать, проверять, публиковать и распространять таким образом, чтобы их можно было повторно использовать в ближайшем будущем. мир данных », — заключил профессор Пенев.«Секвенирование следующего поколения выходит за рамки объединения генетического плана видов в такие области, как исследования биоразнообразия, с массовыми коллекциями видов в исследованиях« метабаркодирования », которые сближают геномику, мониторинг экосистем и открытие видов.
Этот пример пытается объединить данные из эти различные источники, а также через курирование в BGI и базе данных GigaDB GigaScience, чтобы сделать ее совместимой и гораздо более удобной », — говорит д-р Скотт Эдмундс из BGI и исполнительный редактор GigaScience.