Рыбы в удаленных полярных и глубоководных местообитаниях находятся под угрозой из-за изменения климата и увеличения промысловых усилий, что делает важным мониторинг популяций. Однако мониторинг может быть затруднен с точки зрения логистики и в настоящее время зависит от инвазивных методов, таких как донное траление, и недостоверных отчетов об уловах. Следовательно, необходимы менее инвазивные и более надежные методы мониторинга.
Чтобы удовлетворить эту потребность, Томсен и его коллеги оценили альтернативный метод мониторинга, основанный на секвенировании ДНК окружающей среды (еДНК) в образцах морской воды.
Они собрали образцы морской воды на участках к юго-западу Гренландии на разных глубинах от 188 до 918 метров, секвенировав ДНК в этих образцах, чтобы определить присутствующие виды рыб. Они сравнили эти результаты с данными по уловам, полученными при одновременном тралении на каждом участке.
Томсен и его коллеги обнаружили, что данные о биомассе и численности рыб коррелировали с численностью последовательностей эДНК. Двадцать шесть семейств рыб, включая скатов и палтуса, были идентифицированы с помощью методов траления и анализа ДНК в окружающей среде, по сравнению с двумя семействами, обнаруженными только при тралении, и тремя, обнаруженными только в электронной ДНК.
Отбор образцов ДНК из окружающей среды также выявил более высокую численность гренландской акулы, чем при траловом промысле, что может указывать на то, что этот метод может эффективно обнаруживать крупную рыбу, которая может уклоняться от траловых сетей.
Отбор образцов ДНК из окружающей среды необходимо будет пройти дальнейшее тестирование, чтобы определить его эффективность в качестве метода мониторинга.
Тем не менее, авторы заявляют, что их исследование демонстрирует, как электронная ДНК может быть использована в неинвазивном мониторинге, для коммерческого рыболовства, а также для оценки воздействия изменения климата на биоразнообразие этих удаленных экосистем.