Из этого понимания возник спор: как такие белки проводят свое время, плавая в клетке. Поскольку они не сложены в точную форму, они сжимаются в шарики или остаются растянутыми, как веревка?
Разные методы дали разные результаты. Рассеяние с использованием рентгеновских лучей показало, что они оставались расширенными, но флуоресцентные методы наблюдали противоположное поведение. Ответ может повлиять на то, как мы представляем себе движение белка в течение его жизни — это важно для понимания того, как белки складываются, что идет не так во время расстройств и болезней и как моделировать их поведение.
Команда исследователей из Чикагского университета и Нотр-Дама использовала моделирование и рентгеновские лучи, чтобы решить этот вопрос.
Результаты, опубликованные окт. 13 в науке, пришли к выводу, что эти белки остаются развернутыми и расширяются, поскольку они свободно плавают в цитоплазме клетки.
«Нам нужно определить, насколько они« липкие », — сказал соавтор профессор Проф. Тобин Сосник, заведующий кафедрой биохимии и молекулярной биологии, директор магистерской программы по биофизическим наукам и член Института вычислений и Института молекулярной инженерии. «Для выживания вы хотите, чтобы белок« прилипал »только к правильной конформации и с другими нужными частями или партнерами в нужное время."Эта липкость определяется химическим составом и физикой протеина.
Команда Сосника придумала способ проанализировать одно рентгеновское измерение для определения липкости, обнаружив, что белки, как правило, гораздо менее липкие, чем ожидалось. Их химия настроена, предпочитая взаимодействовать с водой, а не с самим собой или другими белками.
"Результаты очень ясны, но противоречат текущему консенсусу", — сказал Сосник. "Возможно, белки могут избежать нежелательных взаимодействий за счет увеличения."Это снижает вероятность того, что они случайно прилипнут к другим белкам, что приведет к дисфункции или заболеванию.