Это еще больше усложняется тем фактом, что разные группы растений имеют разные соединения и, следовательно, могут потребоваться разные методы экстракции ДНК для получения достаточной высокомолекулярной ДНК в зависимости от вида, с которым вы работаете.Мёллер, Гивниш и их коллеги из Университета Висконсин-Мэдисон оценили новый метод выделения ДНК и сравнили его с двумя часто используемыми методами выделения ДНК из тканей растений. Новый метод основан на частицах парамагнитной целлюлозы MagnaCel (PMC) и изначально был разработан и разработан для криминалистических приложений, в которых присутствуют лишь незначительные количества ДНК.Полезность метода PMC сравнивалась как с методом колонок с диоксидом кремния (DNeasy Plant Mini Kit), так и с методом бромида цетилтриметиламмония (CTAB).
Это сравнение было проведено среди широкого спектра цветковых растений, от лилий до подсолнухов. Метод PMC оказался более эффективным и, в отличие от метода CTAB, не предполагает использования опасных химикатов.
Наиболее важно то, что выход ДНК из PMC был вдвое больше, чем у DNeasy или CTAB.«Мы стремились изучить методы, которые могли бы сократить время и трудозатраты, необходимые для надежного получения геномной ДНК из образцов листьев таксонов с очень широким диапазоном химического состава листьев», — говорит Гивниш.
Статистический анализ был проведен для проверки значительных различий в качестве и количестве ДНК, полученной между методами экстракции и различными тестируемыми видами. «Мы считаем, что это исследование представляет собой убедительный тест на эффективность выделения ДНК парамагнитной целлюлозы по сравнению с другими методами. Мы обнаружили, что набор для экстракции ДНК MagnaCel от Promega значительно превосходит экстракции CTAB и DNeasy, обеспечивая в среднем вдвое больший выход ДНК для 25 видов растений. в 21 семье и обеспечивает более стабильную чистоту ДНК на основе коэффициентов поглощения при 260 нм по сравнению с 280 нм и 230 нм », — объясняет Гивниш. «Преимущество подхода MagnaCel особенно велико при низких концентрациях ДНК».