Орин С. Шанкс, Хаятт С. Грин и его коллеги объясняют, что наши водные пути подвержены воздействию многих источников фекального загрязнения, включая утечки сточных вод и помет сельскохозяйственных животных и диких животных. Загрязнение фекалиями собак вызывает беспокойство, поскольку они могут содержать устойчивые к антибиотикам штаммы кишечной палочки и других бактерий и паразитов, которые могут заразить людей — а в США около 70 миллионов домашних собак. У ученых было мало инструментов для определения степени распространения. к которому отходы собак добавляют болезнетворные микроорганизмы в реках, озерах и прибрежном серфинге.
Современные методы ищут определенные гены в кишечных бактериях, которые попадают в фекалии собак. Однако это не является надежным — микробиота людей и домашних питомцев, с которыми они живут, часто пересекаются, что усложняет анализ.
Поэтому команда Шанкса приступила к созданию более конкретного теста.Исследователи разработали новый метод генетического тестирования, специально предназначенный для обнаружения фекалий собак в воде. Они идентифицировали 11 генетических маркеров, которые были распространены среди большинства образцов собак, но отсутствовали в образцах человека. Чтобы определить, подойдет ли их метод для реального мониторинга, они взяли пробы ливневой воды из дождевого сада, где люди часто выгуливают своих собак.
Этот метод успешно обнаружил некоторые из тех же маркеров, которые они определили в качестве доказательства собачьих отходов.