Олени (Cervidae) обитают почти на всех континентах, и, как парнокопытные жвачные животные, они тесно связаны с нашими современными видами домашнего скота. Однако, несмотря на большую работу, филогения цервид до сих пор полностью не выяснена. Чтобы реконструировать эволюционную историю группы и прояснить отношения между ее членами, необходимы молекулярно-филогенетические данные.
Исследователи Никола Хекеберг, Гертруда Росснер и ее коллеги из Департамента наук о Земле и окружающей среде в LMU и Баварской государственной коллекции палеонтологии и геологии) частично секвенировали образцы митохондриальной ДНК из музейных образцов пяти видов оленей, молекулярные данные по которым ранее не были доступны. «Эта работа также способствует сохранению природы», — говорит Хеккеберг. "Только если мы сможем определить границы видов, мы сможем оценить, находится ли этот вид под угрозой исчезновения."Исследователи сообщают о своих новых открытиях в онлайн-журнале PeerJ.
«Молекулярные данные уже были доступны для 46 из 55 ныне живущих видов цервид», — говорит Хеккеберг. «Наша цель состояла в том, чтобы дополнить этот набор данных и поместить вновь секвенированные виды в генеалогическое древо цервид."Поскольку указанные виды уже редки и их трудно собрать в дикой природе, исследователи использовали материал из 13 музейных образцов и извлекли ДНК из образцов костей, кожи и высушенных остатков мягких тканей.
Некоторым из этих образцов было более 100 лет, и, таким образом, ДНК была разрушена. Тем не менее, исследователям удалось секвенировать фрагменты этой древней ДНК, соответствующие части генома митохондрий (органелл, ответственных за синтез АТФ, который обеспечивает химические реакции в ядросодержащих клетках).
Таким образом, Хеккеберг смог подтвердить, что вторая форма мунтжака (Muntiacus atherodes), обнаруженная на Борнео (вместе с М. muntjac) является истинным видом, в то время как филиппинский пятнистый олень (Rusa alfredi), по-видимому, представляет подвид филиппинского коричневого оленя (R. Марианна). Два рода оленей Нового Света, Мазама и Пуду, оказались полифилетическими, что уже было известно по Мазаме, но впервые было показано в Пуду. Таким образом, морфологические сходства, которые привели к их классификации в одну кладу, не являются результатом их происхождения от общего предка, а отражают адаптации к родственным средам (конвергентная эволюция).
Новые данные о последовательностях были депонированы в общедоступных базах данных и находятся в свободном доступе для использования другими исследователями в дальнейших исследованиях филогении шейки матки.