Секвенирование генома энтеровируса D68, циркулирующего в St. Луи

Секвенирование генома энтеровируса D68, циркулирующего в St. Луи

«Наличие последовательности ДНК этого вируса позволяет провести дополнительные исследования», — сказал старший автор Грегори А. Сторч, доктор медицины, Рут Л. Siteman профессор педиатрии. "Его можно использовать для создания более качественных диагностических тестов. Это также может помочь нам понять, почему эта эпидемия, по-видимому, вызывает серьезное и необычное заболевание и почему она распространяется более широко, чем в прошлом."
Работа появляется окт. 28 в новых инфекционных заболеваниях.

Исследователи опубликовали последовательности ДНК в GenBank, базе данных с открытым доступом, поддерживаемой Национальными институтами здравоохранения (NIH).
Новые данные секвенирования, подготовленные Институтом генома Вашингтонского университета, включают одну полную последовательность генома и восемь частичных последовательностей, взятых из образцов пациентов. Кроме того, ученые из Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) внесли в GenBank семь полных или частичных последовательностей энтеровируса D68, отобранных на Среднем Западе.
Сторч сказал, что обычные лабораторные тесты не могут идентифицировать конкретные штаммы энтеровирусов.

Большинство больниц и клиник могут проводить тесты только для определения наличия у пациента вируса, который в целом относится к категории энтеровирусов / риновирусов. В новом исследовании Сторч и его коллеги проанализировали образцы 14 пациентов с положительными результатами на энтеровирус / риновирус.

Девять из них были идентифицированы как энтеровирус D68 с использованием специализированных лабораторных методов, разработанных в Вашингтонском университете и Сент-Луисе. Детская больница Луи.

Остальные пять образцов были другими респираторными вирусами.
Хотя многие дети могут заразиться энтеровирусом D68 и никогда не узнать об этом из-за легких симптомов, другим может потребоваться госпитализация, чтобы поддержать дыхание. Дети с нарушениями дыхания в анамнезе, такими как астма, подвержены более высокому риску тяжелого заболевания.

В этом исследовании у семи из девяти пациентов со штаммом D68 было тяжелое заболевание, которое потребовало госпитализации в педиатрическое отделение интенсивной терапии. У остальных двух были умеренные симптомы, в результате чего была госпитализирована.

Из пяти пациентов с другими вирусами трое были классифицированы как тяжелые. Единственные два пациента, выписанных домой с легкой формой заболевания, не имели штамма D68.

«В настоящее время нет специального лечения и вакцины от этого вируса», — сказал Сторч, который лечит пациентов в больнице Св. Детская больница Луи. "Но доступность последовательности ДНК помогает достичь обеих этих целей."
Эти данные также позволяют сравнивать штаммы, циркулирующие в разных частях страны.

«Центр контроля заболеваний опубликовал несколько дополнительных геномов из Миссури, Иллинойса и Кентукки», — сказала первый автор Кристин М. Вайли, доктор философии, преподаватель педиатрии. "Геномы Миссури, в том числе наш, очень похожи, но геномы Иллинойса и Кентукки отличаются от геномов Миссури, что позволяет предположить, что в США циркулируют несколько различных штаммов.S. Сейчас."

Уайли также указал на важность продолжения изучения генетических особенностей этого вируса и наблюдения за здоровьем пациентов со штаммом D68.
«До недавнего времени этот вирус был довольно редким», — сказала она. "Было бы полезно получить больше данных о вирусе и пациентах, чтобы мы могли начать связывать генетические особенности вируса с серьезностью заболевания."