До сих пор данные о болезнях и географическая информация о перемещении инфекции или заболевания по мере их развития и распространения были заблокированы в базах данных, которые часто были недоступны для людей. Исследователям было оставлено полагаться на опубликованную информацию в исследовательских статьях, которые могут быть устаревшими на много месяцев и содержать статичные визуальные эффекты, показывающие лишь небольшую часть всей болезни или угрозы заражения.Microreact — это облачная система, которая сочетает в себе возможности открытых данных и Интернета, обеспечивая глобальный обмен и визуализацию данных в реальном времени, позволяя любому исследовать и изучать информацию о вспышках с беспрецедентной скоростью и детализацией. Это становится все более важным в гонке за мониторинг и борьбу с быстро развивающимися вспышками, такими как Эбола или Зика, или растущей угрозой устойчивости к противомикробным препаратам.
Microreact позволяет загружать наборы данных и метаданных через веб-браузер, которые затем можно визуализировать, совместно использовать и опубликовать в исследовательской работе через постоянную веб-ссылку. Партнерство с Microbial Genomics позволяет журналу делать данные из перспективных публикаций доступными через Microreact. Это способствует открытой доступности и доступу, а также способствует созданию уникального ресурса для специалистов в области здравоохранения и ученых во всем мире.
Д-р Дэвид Аненсен, директор Центра по надзору за геномными патогенами (совместная инициатива Имперского колледжа Лондона и Института Сэнгера) и один из создателей Microreact, сказал: «До сих пор мировое исследовательское сообщество испытывало затруднения, потому что результаты обычно делятся в статических изображениях или таблицах в публикациях. Microreact позволяет каждому динамически исследовать информацию — как во времени, так и в пространстве — позволяя им видеть полную картину. Использование Microreact позволяет отслеживать болезни в руках немногих избранных и дает ее всем, кто хочет понять эволюцию болезни ".Одним из примеров того, как Microreact может демократизировать геномные данные и полученные результаты, является работа доктора Кэтрин Холт и профессора Гордона Дугана.
Недавно они опубликовали две статьи о глобальном распространении тифозных бактерий по всему миру, показывающих эпидемическое распространение штамма с множественной лекарственной устойчивостью. Но они также опубликовали свои данные в Microreact, чтобы помочь другим продолжить их работу.Д-р Кэтрин Холт из Мельбурнского университета сказала: «Мы собрали данные из почти 2000 образцов бактерий Salmonella Typhi, собранных 74 сотрудниками в 63 странах. Сравнивая различные штаммы и отображая их, когда и где они были« пойманы », мы смогли показать, что новый устойчивый к лекарствам штамм появился в Азии и распространился по этому континенту и в Африке.
Мы поместили всю эту информацию на Microreact, и теперь любой может увидеть именно то, что мы видели — и ученые, и эти специалисты в области общественного здравоохранения. поручено контролировать такие вспышки ".Поместив эту информацию в Microreact, исследователи убедились, что данные продолжают жить, позволяя другим учиться на их работе и использовать информацию в качестве основы для сравнения или основы для будущей работы.
Microreact также позволяет отдельным исследователям обмениваться информацией в глобальном масштабе и в режиме реального времени, собирая новые открытия и идеи, которые могут иметь немедленный эффект.Лейтон Чипперфилд, директор по публикациям Общества микробиологов, сказал: «Мы рады, что наш журнал с открытым доступом и открытыми данными Microbial Genomics сотрудничает с Microreact. Все проекты Microreact, которые появляются в статьях Microbial Genomics, будут освещены на веб-сайте журнала, чтобы повысить обнаруживаемость и доступность наборов данных исследователей ".
