Оценка платформ для количественной экспрессии микроРНК в исследовании контроля качества микроРНК (miRQC)

РНК (рибонуклеиновая кислота) — химическое происхождение жизни. Существует несколько классов молекул РНК, при этом микроРНК являются одними из самых коротких молекул РНК, продуцируемых живой клеткой человека.

Несмотря на свой небольшой размер, они играют важную роль в регулировании экспрессии гораздо более длинных белок-кодирующих информационных РНК. Уровни экспрессии микроРНК изменяются во время болезни человека, и эти изменения могут наблюдаться в пораженных тканях, а также в жидкостях организма пациента, таких как сыворотка или плазма. Таким образом, микроРНК стали привлекательными кандидатами в биомаркеры болезней, а также мишенями для новых терапевтических вмешательств.Обнаружение и количественное определение таких малых РНК является сложной задачей и требует современного лабораторного оборудования, которое позволяет надежно определять количество микроРНК.

За последнее десятилетие было разработано несколько технологий профилирования уровня экспрессии микроРНК. Однако их работа никогда не подвергалась тщательной оценке.

В исследовании контроля качества микроРНК (miRQC) исследователи из Гентского университета объединились со всеми основными коммерческими поставщиками технологии профилирования микроРНК, чтобы оценить производительность 12 различных платформ профилирования микроРНК. Оценивая различные аспекты производительности платформы, такие как специфичность, чувствительность, точность и воспроизводимость, исследование miRQC демонстрирует, что оптимальный выбор платформы сильно зависит от конкретной цели эксперимента по профилированию микроРНК. В то время как некоторые платформы более чувствительны, что имеет особое значение при профилировании микроРНК в жидкостях организма, другие более воспроизводимы и позволяют обнаруживать небольшие изменения экспрессии микроРНК.

Таким образом, результаты исследования miRQC должны помочь исследователям в выборе платформы для профилирования экспрессии микроРНК в зависимости от их конкретных целей исследования.