При лучевой терапии рака не само излучение напрямую повреждает нити ДНК или олигонуклеотиды. Скорее, это вторичные реактивные частицы, приводящие к созданию заряженных промежуточных продуктов. Здесь авторы изучили один из этих заряженных интермедиатов в виде так называемых протонированных метастабильных гексамеров ДНК. Для этого авторы создали выбранные комплексы олигонуклеотид-металл-ион, которые они выбрали, чтобы иметь от нуля до шести ионов металла.
Затем они проследили реакции фрагментации этих комплексов, используя метод, называемый времяпролетной масс-спектрометрией. Сравнивая различные виды, они могли сделать вывод, как работает основная фрагментация олигонуклеотидов, вызванная ионами металлов.
Они обнаружили, что индуцированная ионами металлов фрагментация олигонуклеотидов универсальна для всех ионов щелочных и щелочноземельных металлов, например лития, Li +; калий, К +; рубидий, Rb +; магний, Mg2 + и кальций, Ca2+.
Ранее они пришли к такому же выводу для ионов натрия, которые повсеместно встречаются в природе в форме хлорида натрия или соли. Как показывает исследование, когда количество ионов натрия на нуклеотид становится достаточно высоким, запускается неожиданная реакция фрагментации олигонуклеотидов.