Ретровирусы, в том числе ВИЧ у людей, должны стать частью генома клетки-хозяина, чтобы производить новые вирусы. Иногда ретровирусы проникают в половые клетки и вертикально передаются потомству хозяина в виде ERV. Следовательно, ERV составляют большие части геномов позвоночных и представляют собой запись прошлых взаимодействий хозяина и ретровируса.
«Это исследование демонстрирует мощный ресурс, представленный записью геномной ERV для лучшего понимания коэволюции ретровируса и хозяина», — говорит Патрик Джерн, научный сотрудник кафедры медицинской биохимии и микробиологии Уппсальского университета, возглавлявший исследование.Исследователи использовали последние технологические достижения в анализе больших данных последовательностей всего генома для нового понимания эволюции ретровирусов, разнообразия, смены хозяев и факторов, влияющих на передачу ретровирусов.
Около 36000 ERV, извлеченных из 65 геномов позвоночных, показывают, что ретровирусы широко распространены среди позвоночных и что ретровирусные линии либо недолговечны в течение эволюционного периода, либо значительное количество ретровирусов ожидает открытия. Ни одна из основных исследованных клонов позвоночных не избежала ретровирусной активности, и ретровирусы, по-видимому, являются крайними универсальными хозяевами, которые часто переключаются между отдаленно родственными позвоночными-хозяевами.
«Мы надеемся, что эти методы будут полезны в будущих исследованиях, поскольку они позволят получить дополнительные знания об эволюционной экологии вирусов и их видов-хозяев», — говорит Патрик Джерн.