Селекционеры и ученые по всему миру смогут загрузить и использовать этот бесценный новый ресурс для ускорения программ улучшения сельскохозяйственных культур и исследований геномики пшеницы. Набор данных облегчит идентификацию генов, связанных с важными сельскохозяйственными признаками, такими как повышение урожайности, реакция на стресс и устойчивость к болезням, и, в конечном итоге, сделает возможным производство улучшенных сортов пшеницы для фермеров.С момента анонса в январе команда проекта IWGSC уточняла данные, чтобы сборка генома, представленная научному сообществу, имела максимально возможное качество.
Опубликованный сегодня ресурс, основанный на данных секвенирования Illumina, собранных с помощью программного обеспечения NRGene DeNovoMAGICTM, точно представляет более 90 процентов очень сложного генома мягкой пшеницы, содержит более 97 процентов известных генов и связывает данные с 21 хромосомой пшеницы.Этот выпуск данных представляет собой продолжающиеся усилия IWGSC по созданию «золотой стандартной эталонной последовательности» — полной карты всего генома, которая точно позиционирует все гены и другие геномные структуры вдоль 21 хромосомы пшеницы. Геном пшеницы большой — в пять раз больше генома человека — и сложный, с тремя наборами из семи хромосом.«Политика IWGSC всегда заключалась в том, чтобы сделать все данные общедоступными, как только они пройдут проверку качества», — пояснила исполнительный директор IWGSC Келли Эверсол. «Таким образом, научное сообщество может начать использовать данные прямо сейчас, в то время как Консорциум продвигается к созданию эталонной последовательности золотого стандарта, которая, как ожидается, будет выпущена в 2017 году».
Как это принято в научном сообществе, набор данных предоставляется для разведения и исследований в соответствии с «Заявлением Торонто», в котором изложены правила обмена данными перед публикацией, в соответствии с которыми IWGSC оставляет за собой право публиковать первый анализ данных, который включает описание всей хромосомы или анализа генов на уровне генома, семейств генов, повторяющихся элементов и сравнения с другими организмами. Подробная информация о том, как получить доступ к данным, доступна на веб-сайте IWGSC.
В ближайшие месяцы команда проекта IWGSC продолжит свою работу по завершению высококачественной упорядоченной последовательности генома пшеницы, которая включает аннотирование и определение точного расположения генов, регуляторных элементов и маркеров вдоль хромосом, тем самым предоставляя бесценные инструменты для селекционеры пшеницы. Окончательный результат объединит все геномные ресурсы, созданные под эгидой IWGSC за последнее десятилетие, включая индивидуальные физические и генетические карты.Пшеница является основным продуктом питания более трети мирового населения и составляет 20% всех потребляемых в мире калорий. По мере роста мирового населения растет и его зависимость от пшеницы.
Чтобы удовлетворить будущие потребности прогнозируемого населения мира в 9,6 миллиарда к 2050 году, урожайность пшеницы должна увеличиваться на 1,6% каждый год. Чтобы сохранить биоразнообразие, водные и питательные ресурсы, большая часть этого увеличения должна быть достигнута за счет улучшения урожая и характеристик земель, обрабатываемых в настоящее время, а не использования новых земель для возделывания.
Что касается других основных сельскохозяйственных культур, хорошо аннотированная эталонная последовательность генома будет неоценимым ресурсом для достижения этой цели, поскольку она предоставит подробные карты генов и генных сетей, которые можно улучшить путем селекции.