Одним из способов, которым иммунная система обнаруживает инфекцию, является представление коротких пептидов, полученных от патогена, Т-клеткам, которые различают чужеродные и собственные антигены. Исследование показывает, что поверхностный белок гемагглютинин (НА) H7N9 развил набор мутаций, которые делают его похожим на человеческие белки, и, таким образом, представленные пептиды напоминают аутоантигены. Штамм гриппа H7N9, по-видимому, эффективно маскируется от иммунной системы.
«Первоначальное наблюдение низкого содержания эпитопа Т-клеток H7N9 было сделано до того, как стали доступны какие-либо данные об эффективности вакцины», — говорит старший автор, профессор Энн С. Де Гроот, директор Института иммунологии и информатики Университета Род-Айленда. Генеральный директор EpiVax, Inc. «Оказывается, мы были абсолютно правы. По сравнению с H1N1 и H3N1 вакцины от H7N9 гораздо менее иммуногенны».
Исследовательская группа профессора Де Гроота разработала вычислительный инструмент JanusMatrix, способный определять, похож ли данный вирусный белок на какой-либо человеческий белок по остаткам, имеющим отношение к презентации антигена.«JanusMatrix смотрит на обе« стороны »Т-клеточных эпитопов. Он начинает с рассмотрения лица, которое связывается с HLA или MHC — обращенными вниз аминокислотами, которые связываются в карманах связывания MHC.
Определив, что пептид может связываться с конкретный MHC, программа затем смотрит на поверхность рецептора Т-клеток (лицо TCR) и просматривает базу данных предварительно проанализированных пептидов из генома человека, которые были идентифицированы как связывающиеся с одним и тем же MHC, для пептидов, которые имеют одинаковые Аминокислоты, обращенные к TCR ".Оказалось, что, помимо низкого содержания эпитопа Т-клеток, НА из H7N9, но не из других исследованных штаммов гриппа, демонстрирует высокое сходство с несколькими эндогенными белками.Гипотеза иммунного камуфляжа была проверена путем стимуляции мононуклеарных клеток периферической крови от наивных доноров пептидами, производными от H7N9. Примечательно, что чем больше пептид напоминал аутоантиген, тем меньше он был способен вызывать Т-клеточный ответ.
Кроме того, предсказанные человекоподобные антигены увеличили и активировали регуляторные Т-клетки, которые ответственны за подавление иммунитета при представлении эндогенных пептидов, что дополнительно подтверждает гипотезу.«Похоже, что этот новый механизм иммунного бегства может быть общим для многих патогенов человека», — говорит профессор Де Гроот. «Мы работаем над проверкой нескольких других пептидов, некоторые из обычных сезонных штаммов гриппа, а некоторые из таких патогенов, как ВИЧ и M. tuberculosis, которые действительно длительное время живут внутри своих хозяев».По данным Центров США по контролю и профилактике заболеваний, грипп H7N9 заразил почти 670 человек и привел к 230 смертельным случаям.
Эти результаты могут способствовать разработке эффективной вакцины и повлиять на исследования вакцины в целом. «Это вполне может объяснить, почему некоторые вакцины-кандидаты от патогенов, которые эволюционировали вместе с людьми, — например, туберкулез и ВИЧ — не работают так хорошо. Это также предполагает, что« настройка »белков патогенов для удаления этих маскирующих последовательностей приведет к вакцины лучше и эффективнее », — заключает профессор Де Гроот.