Люди с низким уровнем IgA подвержены более высокому риску развития рецидивирующих инфекций, аллергии и аутоиммунитета. Основные генетические факторы дефицита IgA до сих пор в значительной степени неизвестны.
Ранее та же исследовательская группа определила несколько пород собак, склонных к низким уровням IgA, а также обнаружила, что уровни IgA широко варьируются между породами [doi: 10.1016 / j.vetimm.2014.05.010.160.]. В этом текущем исследовании исследователи провели полногеномные ассоциативные исследования (GWAS) у четырех из этих пород, склонных к низким уровням IgA. Миа Олссон, постдок факультета медицины Каролинского института и первый автор исследования, поделился своим комментарием о ценности собак при изучении этого заболевания:«Поскольку определенные породы собак склонны к чрезвычайно низким уровням IgA и имеют симптомы, аналогичные симптомам у пациентов с дефицитом IgA, они представляют собой отличные модели для картирования генов, участвующих в этом очень сложном заболевании».
В частности, исследователи идентифицировали три новых гена-кандидата; KIRREL3 и SLIT1, с документально подтвержденной ролью в развитии иммунных клеток, и SERPINA9 экспрессируются исключительно в том месте (зародышевом центре), где B-клетка начинает продуцировать IgA.Исследователи также представляют недавно разработанный метод анализа сложной непрерывной характеристики в GWAS.
Катарина Тенгвалл, докторант кафедры медицинской биохимии и микробиологии Университета Упсалы и первый автор исследования, отмечает, что для анализа этой черты у собак требовалась новая стратегия:«Из-за больших различий в IgA между породами собак, до сих пор не установлено граничное значение, позволяющее отличить нормальный уровень IgA от аномального».Это мешает классическому способу выполнения GWAS, в котором обычно сравниваются группы пострадавших и незатронутых. Более того, использованию непрерывного GWAS препятствовали естественные колебания концентраций IgA.«Чтобы обеспечить надежные GWAS, мы разделили собак на ряды перцентильных групп, чтобы отразить распределение IgA для конкретных пород, и выполнили несколько GWAS.
В конце мы объединили их в один окончательный GWAS для каждой породы, тем самым удалив ложные ложные сигналы и успешно определив связанные области генома », — говорит Катарина Тенгвалл.Таким образом, исследователи пролили свет на сложное заболевание, предложив новые гены-кандидаты, а также представив новый метод анализа признака на основе непрерывной переменной (в GWAS).
«Мы продолжим изучать эти гены и их потенциальное участие в дефиците IgA у собак, и мы ожидаем, что это будет иметь значение также для человеческого эквивалента», — говорит Миа Олссон.