Однако часто они работают всего год или меньше. Ученым известны некоторые мутации ДНК, которые вызывают устойчивость к лекарствам, но ученые не смогли определить основную причину устойчивости у трети этих пациентов. В результате определение методов последующего наблюдения на основе генома для этих пациентов оказалось сложной задачей.Исследователи из онкологического центра доктора медицины Андерсона Техасского университета, возможно, нашли способ более точно предсказать, какие пациенты, вероятно, будут реагировать на последующие методы лечения, основанные на геноме, путем изучения уникальных «белковых структур» у пациентов с меланомой.
«Есть пациенты, ДНК которых не показывает, как их меланомы стали устойчивыми к ингибиторам BRAF», — сказал Лоуренс Квонг, доктор философии, инструктор по геномной медицине в MD Anderson. «Итак, мы изучили закономерности изменений в 150 белках, которые могут дать ключ к разгадке причин устойчивости, даже если данные секвенирования ДНК неинформативны».Квонг является первым автором статьи об исследовании BRAF, которая опубликована 23 февраля в онлайн-выпуске Journal of Clinical Investigation (JCI).«Ингибиторы BRAF эффективны у пациентов с меланомой, опухоли которых имеют мутацию« горячей точки »в гене рака BRAF», — сказала Линда Чин, доктор медицины, заведующая кафедрой геномной медицины и автор статьи JCI. «К сожалению, почти всегда у этих пациентов развивается резистентность к лекарству. Поэтому выяснение того, как меланома распространяется вокруг лекарства, является важным первым шагом в выборе альтернативной терапии для этих пациентов, когда у этих пациентов развивается резистентность, или, что еще лучше, способ лечения этих пациенты с комбинациями, предотвращающими появление резистентности ».
Команда Квонга и Чина проанализировала устойчивость к ингибиторам BRAF, используя модель меланомы мыши BRAF и образцы биопсии опухоли человека. Они обнаружили, что такое «профилирование протеома» может обеспечить быстрое представление о паттернах устойчивости к ингибиторам BRAF у пациентов с меланомой за небольшую часть стоимости секвенирования ДНК или РНК.В дополнение к этим результатам, результат исследования также показал возможность использования данных о РНК и белках в качестве потенциальных «биомаркеров», чтобы помочь предсказать, как долго пациент будет реагировать на лечение ингибитором BRAF, чтобы можно было рассмотреть возможность использования комбинированной терапии или терапии второй линии в более индивидуальный подход.«Эти биомаркеры включают гены, которые отслеживают, насколько быстро опухоли растут и насколько активна иммунная система в опухоли», — сказал Квонг. «Это повышает вероятность того, что биопсии перед лечением могут быть использованы для принятия решений по таргетным агентам или иммунотерапии, которые могут быть наиболее эффективными для данного пациента».
Однако ученые предупреждают, что размер исследования был относительно небольшим и потребует дополнительного анализа гораздо более крупных групп пациентов.Исследование финансировалось Национальным институтом рака (T32 CA009599, P30 CA016672); Национальные институты здравоохранения (1K08 CA160692-01A1, P01 CA160692-01A1, P01 CA163222-02, U01 CA168394 и U54 CA163125); Фонд медицинских исследований Адельсона и программа стипендий Американского онкологического общества.
Среди участников исследования доктора медицины Андерсона были Тимоти Хелмс, Ахмад Акид, Джон Миллер, доктор философии, Шан Цзян, доктор философии, и Дженнифер Камара, и Дженнифер Варго, доктор медицины, Департамент геномной медицины; Женевьева Боланд, доктор медицины, доктор философии и Закари Купер, доктор философии, отделение хирургической онкологии; Синчжи Сун, доктор философии, Сахил Сет и Алексей Протопопов, доктор философии, Институт прикладных онкологических наук; и Гордон Миллс, доктор медицины, доктор философии, факультет системной биологии. Массачусетская больница общего профиля также участвовала в исследовании.