«Наш основанный на данных подход к разработке эффективной прогностической геномной подписи для активности E2F4 у пациентов с раком молочной железы ER + дал нам важную информацию для разработки того, что будет простым клиническим тестом, который поможет врачам выбрать наиболее эффективные схемы лечения для каждого пациента», сообщил Ченг. «Кроме того, наш подход очень гибкий, и, поскольку E2F4 широко используется при многих типах рака, он будет очень полезен при решении многих биомедицинских вопросов».С целью разработать точный и быстрый геномный тест для измерения уровней активности регуляторов, связанных с E2F4, команда Ченга обратилась к аномальному поведению факторов транскрипции как к способу отслеживания и прогнозирования первопричины всех видов рака — дисрегулируемого гена. экспрессия, которая приводит к неконтролируемой пролиферации клеток, генезу опухоли и, в конечном итоге, к метастазам.Гены-мишени были идентифицированы с помощью секвенирования иммунопреципитации хроматина (ChIP-seq), и исследователи сравнили показатель регуляторной активности (RAS) E2F4 в раковых тканях, чтобы определить корреляцию с активностью и выживаемостью пациентов.
Прогностическая сигнатура для E2F4 в значительной степени предсказывала исход рака груди у пациента независимо от статуса лечения и состояния многих других клинических и патологических переменных.Ченг объяснил трансляционное использование сигнатуры E2F4: «Разрабатывая гибкий, воспроизводимый и прогнозирующий тест, мы предоставляем врачам, работающим во многих областях рака, информацию, необходимую им для адаптации режимов лечения для конкретных пациентов.
В этом суть персонализированной медицины: правильное лечение для нужного пациента в нужное время ».Следующие шаги команды включают оценку прогностического потенциала E2F4 в дополнительных наборах данных о раке молочной железы, чтобы подтвердить его широкую эффективность, и улучшение сигнатуры путем сведения ее к основным генам-компонентам.