Кристаллическая структура раскрывает новые детали транскрипции нестандартной РНК

«С классической точки зрения рентгеновской кристаллографии можно подумать, что фермент — РНК-полимераза — будет инактивирован, и мы не сможем зафиксировать биохимический процесс в действии в кристаллизованном состоянии», — сказал Кацухико С. Мураками, профессор биохимии и молекулярной биологии в Университете Пенсильвании и автором статьи. «Но в некоторых системах, в том числе в нашей, РНК-полимераза все еще жива, поэтому мы можем контролировать структуры, пока они находятся в процессе создания РНК».Повторяющаяся транскрипция была открыта выпускником Университета Пенсильвании и лауреатом Нобелевской премии по химии Полом Бергом, почетным профессором онкологических исследований Роберта У. и Вивиан К. Кэхилл в Стэнфордском университете в начале 1960-х годов. Хотя это может показаться простой ошибкой при точной транскрипции последовательности ДНК в РНК — повторяющаяся транскрипция происходит, когда цепь РНК скользит относительно цепи ДНК внутри фермента полимеразы — она ​​выполняет функцию в клетке.

Повторяющаяся транскрипция играет ключевую роль в контроле экспрессии многих генов, но, несмотря на эту важную роль, ее механизм остается черным ящиком.«Наша работа», — сказал Вадим Молодцов, научный сотрудник Пенсильванского университета и автор статьи. «Захватив кристаллическую структуру РНК-полимеразы во время повторной транскрипции, мы смогли идентифицировать новый путь, используемый РНК для выхода из фермента.

Вместо того, чтобы уйти через дверь, она выскользнула из окна».