По словам исследователей, этот всеобъемлющий, экологический взгляд на растущую озабоченность в области здравоохранения подчеркивает важную взаимосвязь между устойчивостью к антибиотикам в клинике и микробиологией окружающей среды.«Хотя известно, что в окружающей среде обитают устойчивые к антибиотикам штаммы бактерий, что доказано многими предыдущими исследованиями, мы не знали, насколько они распространены», — говорит Джозеф Несме из Лионского университета во Франции. «Тот факт, что мы смогли обнаружить гены устойчивости к антибиотикам в относительно значительном количестве в каждой тестируемой среде, безусловно, является нашим самым поразительным результатом».
Исследователи, в том числе Несме и старший автор исследования Паскаль Симонет, воспользовались постоянно растущим объемом существующих данных секвенирования следующего поколения, которые находятся в свободном доступе в общедоступных репозиториях, вместе с информацией о генах устойчивости к антибиотикам, обнаруженных у патогенов, инфицирующих пациентов в клиника.«Наша стратегия заключалась в том, чтобы просто использовать все эти ранее существовавшие данные и объединить их для более точного ответа на вопрос о распространенности устойчивости к антибиотикам в окружающей среде», — говорит Несме.Анализ ученых выявил детерминанты гена устойчивости к антибиотикам во всех 71 среде, представленной в общедоступных данных, включая почву, океаны и человеческие фекалии.
Авторы обнаружили, что образцы, собранные из почвы, содержат самый разнообразный пул генов устойчивости. Наиболее распространенными типами обнаруженной резистентности были эффлюксные насосы и другие гены, обеспечивающие устойчивость к ванкомицину, тетрациклину или бета-лактамным антибиотикам, которые широко используются в ветеринарии и здравоохранении.
Все это, и Саймонет говорит, что они знают, что современные технологии все еще неспособны уловить все разнообразие, присутствующее в окружающей среде. Другими словами, нам все еще не хватает части картины.Исследователи объясняют, что есть очень веская причина, по которой микробы будут вооружены генами устойчивости к антибиотикам. В конце концов, большинство антибиотиков, используемых в медицине, в первую очередь изолированы от почвенных микроорганизмов, таких как бактерии или грибки.
Это означает, что гены устойчивости были доступны задолго до того, как люди начали применять антибиотики. Бактерии, у которых их нет, могут просто заимствовать их (путем горизонтальной передачи генов) у тех, кто лучше оборудован.Несме и Симонет говорят, что новые результаты должны стать призывом к более широкому экологическому взгляду на проблему устойчивости к антибиотикам.
«Только имея больше знаний о распространении устойчивости к антибиотикам — от окружающей среды до патогенов в клинике и приводя к частоту неудач лечения антибиотиками — мы сможем производить более устойчивые антибиотики», — говорит Несме.