«Используя новые метагеномные подходы, ученые наконец-то начинают характеризовать таксономическое изобилие и взаимоотношения между сообществами не только бактерий, но и других микробов, населяющих кишечную среду», — говорит профессор Гэри Ву из Университета Пенсильвании, Филадельфия. «Эта захватывающая работа приближает нас на шаг ближе к пониманию важности микробного разнообразия для здоровья и болезней кишечника и может в конечном итоге привести к новым способам диагностики и лечения желудочно-кишечных (ЖКТ) заболеваний».Его выступление было одной из тем, представленных на Всемирном саммите по кишечной микробиоте для здоровья в Майами, Флорида, США.
8-9 марта 2014 г. ведущие мировые эксперты обсудили последние достижения в исследованиях микробиоты кишечника и их влияние на здоровье.Микроорганизмы, населяющие кишечник, можно в общих чертах разделить на прокариот (бактерии и археи), бактериофаги (вирусы, заражающие прокариот), эукариотические вирусы и мейофауну (микроскопически мелкие бентосные беспозвоночные, обитающие как в морской, так и в пресноводной среде — в первую очередь грибы). и простейшие) .1 Из них бактерии изучены наиболее широко.
В настоящее время желудочно-кишечный тракт считается одной из самых сложных микробных экосистем на Земле, и понимание того, как взаимодействуют многочисленные сообщества, представляет как возможности, так и проблемы.«В течение некоторого времени мы знали, что бактерии в кишечнике играют важную роль как в здоровье, так и в болезнях», — говорит профессор Ву. «Также теперь становится ясно, что небактериальная микробиота сложным образом взаимодействует с бактериальной микробиотой, внося свой вклад в эти процессы».
Вирусы в кишечникеНаиболее распространенными вирусами в кишечнике являются бактериофаги. Эти быстроразвивающиеся вирусы могут в 10 раз превышать численность бактерий; они инфицируют и разрушают бактериальные клетки и обладают способностью передавать генетический материал от одной бактерии к другой, что может иметь серьезные последствия для здоровья и болезней желудочно-кишечного тракта.
«Между бактериофагами и бактериями существует связь« хищник-жертва », которая может играть роль в изменении бактериальной микробиоты при таких состояниях, как воспалительные заболевания кишечника (ВЗК)», — говорит профессор Ву. «Тот факт, что бактериофаги вызывают иммунные реакции у бактерий, а также могут передавать геномный материал бактериям, что может изменить их функцию, делает эти вирусы чрезвычайно важными, и нам необходимо знать о них гораздо больше».Мейофауна в микробиотеМетоды секвенирования ДНК также подтвердили присутствие комменсальной мейофауны в желудочно-кишечном тракте, которая может иметь важное значение для укрепления здоровья и развития болезней.1 Считается, что некоторые типы мейофауны (например, гельминты и бластоцисты) защищают от ВЗК, подавляя воспаление, и другие считают, что увеличенное разнообразие грибов может способствовать развитию заболеваний ЖКТ, включая ВЗК.«Было показано, что уменьшение разнообразия грибов коррелирует с увеличением колонизации здоровых бактерий после пробиотической терапии, что предполагает конкуренцию нишевых грибов и бактерий», — говорит профессор Ву. «Этот эффект также проявляется в развитии инфекции Candida слизистой оболочки после лечения антибиотиками».
Небактериальные микробы и будущееПрофессор Ву и другие считают, что важность трансдоменных взаимодействий для здоровья и болезней только начинает проявляться.
Мы надеемся, что изучение сложных взаимоотношений между бактериальными и небактериальными микробами в кишечнике позволит лучше понять патогенные механизмы, что в конечном итоге приведет к новым подходам к диагностике и лечению.