Доктор Очиаи заявил: «Используя только существующие методы, такие как метод фиксации конформации хроматина (3C) и флуоресцентный анализ гибридизации in situ (FISH) с использованием микроскопии высокого разрешения, трудно исследовать зависящие от времени изменения в пространственная организация генома и экспрессия генов. Получение динамической информации необходимо для всестороннего понимания регуляции генов более высокого порядка. Следовательно, требуется разработка новых методов анализа динамики транскрипции генов и пространственной организации ».
Система ROLEX демонстрирует высокую специфичность и не влияет на уровень экспрессии целевого гена. Например, эта система позволила выявить изменения подвижности в масштабе всего субгенома, которые зависят от транскрипционной активности гена Nanog, который кодирует ключевой фактор транскрипции плюрипотентности, в эмбриональных стволовых клетках мыши. Ожидается, что система ROLEX будет использоваться в исследованиях, посвященных изучению динамики регуляции генов более высокого порядка посредством дальнодействующих геномных взаимодействий, а также для оценки того, вызывает ли вариабельность геномной организации клеток межклеточную гетерогенность экспрессии генов. Считается, что такая гетерогенность связана с устойчивостью раковых клеток к противоопухолевым препаратам и с неодинаковой способностью плюрипотентных стволовых клеток дифференцироваться в желаемые типы клеток.
Д-р Очиаи далее заявил: «Система ROLEX предоставит беспрецедентное понимание взаимосвязи между транскрипцией генов и ядерной динамикой в живых клетках. Мы считаем, что система станет мощным инструментом не только в клеточной биологии, но и в других областях, включая биомедицинские. исследования и клиническая терапия ».
Эти результаты были опубликованы в Nucleic Acids Research. Название статьи: «Одновременная визуализация транскрипции и ядерной позиции определенных генов».
