Новые мощные данные о старении головного мозга и черепно-мозговой травме: последний выпуск данных также включает в себя значительные обновления базы данных по типам клеток Аллена и Атласа подключений мозга мыши Аллена

Новые мощные данные о старении головного мозга и черепно-мозговой травме: последний выпуск данных также включает в себя значительные обновления базы данных по типам клеток Аллена и Атласа подключений мозга мыши Аллена

«Сила этого ресурса заключается в его способности анализировать такое большое количество мозгов, а также большое количество типов данных», — говорит Эд Лейн, доктор философии.D., Исследователь из Института исследований мозга Аллена. "Ресурс сочетает в себе традиционную невропатологию с современными" омическими "подходами, чтобы позволить исследователям понять процесс старения, искать молекулярные признаки болезни и определять признаки травмы головного мозга."
Образцы исследований взяты из исследования «Изменения мышления взрослых» (ACT), продолжительного исследования, проведенного доктором. Эрик Б. Ларсон и доктор.

Пол К. Крейн из Института групповых исследований здоровья и Вашингтонского университета для сбора данных о тысячах стареющих взрослых, включая подробную информацию об их истории здоровья и когнитивных способностях. UW Medicine возглавил усилия по сбору посмертных образцов из 107 голов мозга в возрасте от 79 до 102 лет, с тканями, взятыми из теменной коры, височной коры, гиппокампа и белого вещества коры.
«Этот совместный исследовательский проект направлен на решение одной из самых сложных проблем клинической нейробиологии», — говорит д-р.

Ричард Дж. Элленбоген, заведующий кафедрой неврологической хирургии и профессор кафедры неврологической хирургии. "Если человек при жизни получил черепно-мозговую травму, каков риск развития слабоумия??

Мы просто не знаем ответа в настоящее время, но некоторые ответы могут быть найдены в этом всеобъемлющем наборе данных, если люди задают правильные вопросы. Этот вопрос важен из-за неотъемлемого риска для всех, кто занимается спортом, занимается физическими упражнениями или вообще участвует в повседневной деятельности."
«Это исследование стало возможным благодаря удивительной щедрости участников ACT и их семей, невероятному сотрудничеству между нашими партнерами, а также щедрости и дальновидности Пола Г. Фонд семьи Алленов, — говорит д-р. Дирк Кин, со-главный исследователь и директор, UW Neuropathology. "Впервые ученые и клиницисты со всего мира получат доступ к этому уникальному набору данных, который продвинет вперед изучение старения мозга и, мы надеемся, внесет свой вклад в разработку новых диагностических и терапевтических стратегий нейродегенеративных заболеваний."
Последний онлайн-ресурс включает количественные данные изображений, чтобы показать болезненное состояние каждого образца, данные о белках, относящиеся к этим болезненным состояниям, данные экспрессии генов и неидентифицированные клинические данные для каждого случая.

Поскольку данные настолько сложны, онлайн-ресурс также включает серию анимированных «снимков», предоставляющих пользователям динамическую выборку способов опроса данных.

«Из этих данных можно сделать много увлекательных выводов, — говорит Джейн Роскамс, доктор философии.D., Исполнительный директор по стратегии и альянсам Института Аллена. "Это первый в своем роде ресурс, сочетающий в себе различные типы данных и большой размер выборки, что делает его удивительно целостным взглядом на пожилой мозг во всей его сложности."
Исследователи сосредоточились на изучении воздействия ЧМТ легкой и средней степени тяжести на мозг пожилого человека, сравнивая образцы пациентов с самооценкой случаев потери сознания с тщательно подобранной контрольной группой. «Интересно, что хотя мы видим много других тенденций в этих данных, мы не обнаружили отличительных генетических признаков или патологических биомаркеров у пациентов с ЧМТ и потерей сознания в этом популяционном исследовании», — говорит Лейн.

«Этот новый ресурс является прекрасным дополнением к нашему набору ресурсов по открытой науке», — говорит Кристоф Кох, доктор философии.D., Президент и главный научный сотрудник Института исследований мозга Аллена.
"Исследователи со всего мира смогут собирать данные и исследовать многие аспекты мозга пожилых людей, что, как мы надеемся, ускорит открытия о здоровье и болезнях при старении."
Исследование по созданию этого ресурса было профинансировано на 2 доллара США.37 миллионов грантов от Paul G. Фонд семьи Алленов Вашингтонского университета.
Два других ресурса получили значительные обновления в последнем выпуске данных.

База данных типов клеток Аллена теперь включает данные об экспрессии генов в отдельных клетках в дополнение к форме, электрической активности и местоположению в головном мозге. Количество клеток в базе данных также увеличилось, и в сотрудничестве с Blue Brain Project подмножество клеток сопровождается новой надежной биофизической моделью.

Атлас связности мозга Аллена Мыши теперь включает в себя его первую общедоступную версию связности на уровне слоев в зрительной коре головного мозга, включая более конкретное нацеливание на клетки с использованием недавно разработанных методов отслеживания.